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一、概念不同
毒力 ：通常把病原菌的致病性强弱程度称为细菌的毒力。各种病原菌的毒力不尽一致，即使同种细菌也因菌型或菌株的不同而有所差异，将病原菌致病力的强弱程度称为毒力，据此有强毒、弱毒（减毒）和无毒之分。因此，毒力是菌株个体的特征，是量的概念。
致病性：是指细菌能引起感染的能力，即病原菌在一定条件下能在特定宿主体内引起特定疾病的能力。有的病原菌仅对人类有致病性，有的只对某些动物有致病性，有的则对人类和动物都有致病性。不同病原菌对宿主可引起不同程度的病理过程或导致不同的疾病，例如伤寒沙门菌感染引起人类伤寒，而结核分枝杆菌则引起结核病，这是由细菌种属特性（即致病性）决定的。
不同的病原菌对宿主可引起不同的疾病，表现为不同的临床症状和病理变化，也就是说某种病原菌只能引起一定的疾病。因此，致病性是细菌种的特征，是质的概念。
二、确定毒力与致病性的方法不同
在确定一种病原菌的毒力时，最具实用的是半数感染量和半数致死量。
半数感染量
半数感染量是指感染实验动物、鸡胚或细胞后在一定时限内使一半感染发病所需的微生物量。因某些病原微生物只能感染实验动物、鸡胚或细胞，但不引致死亡，只能用ID50来表示其毒力。测定的方法与测定LD50类似，只不过在统计结果时以感染代替死亡。
半数致死量
半数致死量是指能使接种的实验动物在感染后一定时限内死亡一半所需的微生物量或毒素量。测定LD50应选取品种、年龄、体重乃至性别等各方面都相同的易感动物，分成若干组，每组数量相同，以递减剂量的微生物或毒素分别接种各组动物，在一定时限内观察记录结果，最后以生物统计学方法计算出LD50。由于半数致死量采用了生物统计学方法对数据进行处理，因而避免了动物个体差异造成的误差。
确定一种细菌是否具有致病性时，通常使用柯赫法则，包括基因水平的柯赫法则和经典柯赫法则。
基因水平的柯赫法则
随着分子生物学的发展，“基因水平的柯赫法则”（Koch’s postulates for genes）应运而生。其要点是：
(1) 应在致病菌株中检出某些毒力或其产物，而无毒力菌株中则无；
(2) 如有毒力菌株的某个基因被损坏，则菌株的毒力应减弱或消除。或者将此基因克隆到无毒菌株内，后者成为有毒力菌株；
(3) 将细菌接种动物时，这个基因应在感染的过程中表达；
(4) 在接种动物检测到这个基因产物的抗体，或产生免疫保护。该法则也适用于细菌以外的微生物，如病毒。
经典柯赫法则
著名的柯赫法则（Koch’s postulates）是确定某种细菌是否具有致病性的主要依据，其要点是：
(1) 某一种特定的细菌应在同一疾病中发现，在健康者不存在；
(2) 此细菌能被分离培养而得到纯种；
(3) 此细菌纯培养物接种易感动物，能导致同样病症；
(4) 自实验感染的动物体内能重新获得该细菌的纯培养。
当然还有一点也很重要，他们的英文翻译也不同。毒力翻译为virulent。而致病性翻译为pathogenicity！