总肠道菌群检测的样本采集方式及标准化操作要求！_行业新闻

小杨 / 2025-12-03 09:58:38

百欧博伟生物：总肠道菌群检测的样本采集以粪便样本为核心（是肠道菌群最直接的来源），部分特殊场景会辅以肠道黏膜样本，不同采集方式有明确的标准化操作要求，具体如下：

一、核心采集方式：粪便样本采集

粪便样本采集是临床和常规检测中最常用的方式，根据检测目的、样本保存条件分为以下细分类型：

1、新鲜即时采集法

操作：使用无菌一次性粪便采集管（含采样勺），采集排便后新鲜粪便的中段部分（避免接触马桶水、厕纸等污染物），采样量根据检测技术调整：16S rRNA 测序需≥10g，宏基因组测序需 15-20g，代谢产物检测需 5-8g。

保存与运输：采集后立即旋紧采集管（部分采集管含 DNA 保护剂/保存液），室温下可保存 24 小时（含保护剂），无保护剂时需 4℃冷藏且 2 小时内送检；长期保存需 - 80℃冻存，冷链运输温度波动控制在 ±2℃内，运输时长不超过 6 小时。

适用场景：常规菌群组成、功能基因检测，代谢产物定量分析。

2、居家采样法（标准化套装）

操作：使用商品化无菌采样套装（含采样管、保存液、密封袋、冷链冰袋），按说明书采集粪便样本（采样量≥5g），采样后将样本管密封放入密封袋，再置于冰袋中。

保存与运输：套装含专用保存液时，室温可稳定保存 72 小时，冷藏可保存 7 天；运输时需通过冷链快递，全程温度监控，确保送达实验室时样本未解冻、未污染。

适用场景：大规模人群筛查、居家健康监测，是目前最普及的采样方式。

3、多次采样法

操作：针对菌群动态监测需求，连续 3 天每日采集 1 次粪便样本（每次≥5g），分别标注采样时间，单独保存/运输。

保存与运输：同新鲜即时采集法，需严格区分各次样本，避免混淆。

适用场景：评估益生菌/抗生素干预后的菌群变化、慢性肠病患者的长期监测。

二、特殊采集方式：肠道黏膜样本采集

仅用于临床深度诊疗场景，需通过内镜操作完成，属于侵入性采样：

1、结肠镜活检采样

操作：在结肠镜检查过程中，使用活检钳从结肠黏膜取 2-3 块黏膜组织（每块≥1mm³），立即放入无菌冻存管，加入 RNA/DNA 保护液。

保存与运输：-80℃冻存，干冰运输，运输时长不超过 24 小时。

适用场景：炎症性肠病的精准分型、肠道黏膜相关菌群与疾病关联研究。

2、小肠黏膜采样

操作：通过小肠镜或胶囊内镜辅助活检，采集小肠黏膜组织（采样量≥0.5mm³），处理方式同结肠镜活检样本。

适用场景：小肠菌群失衡相关疾病的诊断。

3、采样关键注意事项

采样前 3-7 天需暂停服用抗生素、益生菌、益生元制剂，避免干扰菌群组成；若因临床需求无法停药，需在采样记录表中明确标注用药名称、剂量、停药时间。

采样过程中全程无菌操作，避免手、衣物、环境等污染样本；采样管需清晰标注姓名、采样时间、采样部位。

女性经期、腹泻/便秘急性期需暂缓采样，待状态稳定后再采集，确保样本能反映真实菌群状态。

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