过去200年,有10亿人因结核病(TB)而死亡。直到今天,结核病仍然是造成死亡人数最多的传染病,WTO估计每年有1040万新发结核病患者,每年有170万人因结核病而死亡。此外,研究人员估计全球四分之一的人已经被结核菌潜伏感染,从而成为潜在活动性结核病患者。
目前阻碍全球结核病防控的障碍有三个:
1、结核病的诊断在很大程度上仍然依赖于120年前所开发的、低灵敏度的涂片显微镜检查技术;
2、结核病的预防仍然依赖于100年前所开发的、效果有限的卡介苗(Bacille Calmette-Guérin, BCG);
3、结核病的治疗仍然依赖于已有40至60年历史、治疗效果有限,并且抗药性越来越严重的抗生素。
在这一背景下,多重耐药性(multiple-drug resistance, MDR)和广泛耐药性(extensive-drug resistance, XDR)结核病已成为日益严重的问题。另外,结核病合并HIV感染和结核病合并型糖尿病等也都助长了结核病肆虐。
除了过时的诊断、预防和治疗工具之外,各种教条主义也阻碍了结核病领域的发展。例如,一些科学家认为耐药结核菌对机体的适应性不如药物敏感菌株;一些观点认为结核菌作为一个物种,不同菌株之间并不存在基因型和表型的变异。人类结核病主要由结核分枝杆菌复合体(Mycobacterium tuberculosis complex,MTBC)的成员引起。
MTBC是一组序列相似性非常高(>99%的核苷酸序列一致性)的抗酸杆菌。与其它细菌相比,MTBC成员间几乎没有序列变异,所以多位点序列分型的用途有限,因此MTBC成员之间的生态学和进化关系仍有待进一步探讨。
新一代测序技术的发展可让我们克服以往方法的局限性,在全基因组水平上观察MTBC成员细菌的多样性,从而详细分析MTBC成员细菌多样性的进化推动力。
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