中国微生物菌种查询网厚壁菌门是一大类细菌，多数为革兰氏阳性。少数，如柔膜菌纲（Mollicutes）（如支原体），缺乏细胞壁而不能被革兰氏方法染色，但也和其余的革兰氏阳性菌一样缺乏第二层细胞膜。厚壁菌门这个词原本包括所有革兰氏阳性菌，但目前仅包括低G+C含量的革兰氏阳性菌，而高G+C含量的则被划入放线菌门（Actinobacteria）。厚壁菌门表现为球状或者杆状。
很多厚壁菌可以产生芽孢，它可以抵抗脱水和极端环境。很多环境中都可找到芽孢，很多著名的病原菌都能产生芽孢。有一类厚壁菌，太阳杆菌科可以通过光合作用产生能量。
厚壁菌门主要由芽孢杆菌纲(Bacilli)、梭菌纲(Clostridia)、丹毒丝菌纲(Erysipelotrichia)、热石杆菌纲(Thermolithobacteria)及一些不确定的遗传类群组成。芽孢杆菌纲和梭菌纲构成了厚壁菌门的主体。
厚壁菌门中比较著名的属及其所属的纲目：
1、芽孢杆菌纲（Bacilli）
???芽孢杆菌目（Bacillales）
??????芽孢杆菌属（Bacillus）
??????李斯特氏菌属（Listeria）
???乳杆菌目（Lactobacillales）
??????肠球菌属（Enterococcus）
??????乳杆菌属（Lactobacillus）
??????乳球菌属（Lactococcus）
??????明串珠菌属（Leuconostoc）
??????链球菌属（Streptococcus）
???葡萄球菌目（Staphylococcaceae）
??????葡萄球菌属（Staphylococcus）
2、梭菌纲（Clostridia）
???梭菌目（Clostridiales）
??????梭菌属（Clostridium）
??????优杆菌属（Eubacterium）
??????太阳杆菌属（Heliobacterium）
??? Halanaerobiales
???Natranaerobiales
???Thermoanaerobacterales
3、丹毒丝菌纲（Erysipelotrichia）
???丹毒丝菌目（Erysipelotrichales）
??????丹毒丝菌属（Erysipelothrix）
4、柔膜菌纲（Mollicutes）
???支原体目（Mycoplasmatales）
??????支原体属（Mycoplasma）
??????螺原体属(Spiroplasma)
??????脲原体属(Ureaplasma)
5、Negativicutes
???Selenomonadales
??????鼠孢菌属（Sporomusa）
6、热石杆菌纲（Thermolithobacteria）
???热石杆菌目（Thermolithobacterales）