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普通食品：
小牛葡萄球菌（Staphylococcus vitulinus）、木糖葡萄球菌（Staphylococcus xylosus）、肉葡萄球菌（Staphylococcus carnosus）
可用于食品的菌：
双歧杆菌属：青春双歧杆菌、动物双歧杆菌（乳双歧杆菌）、两歧双歧杆菌、短双歧杆菌、婴儿双歧杆菌、长双歧杆菌；乳杆菌属：嗜酸乳杆菌、干酪乳杆菌、卷曲乳杆菌、德氏乳杆菌保加利亚亚种（保加利亚乳杆菌）、德氏乳杆菌乳亚种、发酵乳杆菌、格氏乳杆菌、瑞士乳杆菌、约氏乳杆菌、副干酪乳杆菌、植物乳杆菌、罗伊氏乳杆菌、鼠李糖乳杆菌、唾液乳杆菌；链球菌属：嗜热链球菌、乳酸乳球菌乳酸亚种、乳酸乳球菌乳脂亚种和乳酸乳球菌双乙酰亚种、费氏丙酸杆菌谢氏亚种、肠膜明串珠菌肠膜亚种
可食用菌种：
清酒乳杆菌、产丙酸丙酸杆菌、乳酸片球菌、戊糖片球菌、马克斯克鲁维酵母
婴幼儿食品：
发酵乳杆菌(Lactobacillus fermentum)、短双歧杆菌(Bifidobacterium breve)
嗜酸乳杆菌（用于1岁以上幼儿的食品）、动物双歧杆菌、乳双歧杆菌、鼠李糖乳杆菌
保健食品：
可用于保健食品的真菌名单：酿酒酵母、产朊假丝酵母、乳酸克鲁维酵母、卡氏酵母、蝙蝠蛾拟青霉、蝙蝠蛾被毛孢灵芝、紫芝、松杉灵芝、红曲霉、紫红曲霉
可用于保健食品的益生菌名单：两岐双岐杆菌、婴儿双岐杆菌、长双岐杆菌、短双岐杆菌、青春双岐杆菌、德氏乳杆菌保加利亚种、嗜酸乳杆菌、干酪乳杆菌干酪亚种、嗜热链球菌、罗伊氏乳杆菌