碳水化合物的代谢试验
1.糖（醇、苷）类发酵试验：肠杆菌科细菌。
2.氧化-发酵试验（O/F试验）：肠杆菌科细菌（发酵型）与非发酵菌（氧化型或产碱型）的鉴别。
3.β-半乳糖苷酶试验（ONPG试验）：迟缓发酵乳糖菌株的快速鉴定。分解乳糖的细菌ONPG试验为阳性，而不发酵乳糖的细菌为阴性。
4.七叶苷水解试验：D群链球菌阳性，其他链球菌阴性。
5.甲基红试验：大肠埃希菌阳性；产气肠杆菌阴性。
6.V-P试验：与甲基红试验结果相反。
蛋白质和氧基酸的代谢试验
1.明胶液化试验：肠杆菌科细菌的鉴别，如沙雷菌、普通变形杆菌、奇异变形杆菌、阴沟杆菌等可液化明胶，而其他细菌很少液化明胶。
2.吲哚（靛基质）试验：肠杆菌科细菌的鉴定。
3.硫化氢试验：沙门菌属、爱德华菌属、亚利桑那菌属、枸橼酸杆菌属、变形杆菌属细菌，绝大多数硫化氢阳性，其他菌属阴性。
4.尿素分解试验：肠杆菌科中变形杆菌属细菌的鉴定。奇异变形杆菌和普通变形杆菌脲酶阳性，另外雷氏普罗威登菌和摩根菌为阳性，而斯氏和产碱普罗威登菌阴性。
5.苯丙氨酸脱氨酶试验：用于肠杆菌科细菌的鉴定。变形杆菌属、普罗威登斯菌属和摩根菌属细菌均为阳性，肠杆菌科中其他细菌均为阴性。
6.氨基酸脱羧酶试验：用于肠杆菌科细菌的鉴定。如沙门菌属中除伤寒和鸡沙门菌外，其余沙门菌的赖氨酸和鸟氨酸脱羧酶均为阳性。志贺菌属除宋内和鲍氏志贺菌外，其他志贺菌均为阴性。
碳源和氮源利用试验
1.枸橼酸盐利用试验：在肠杆菌科中埃希菌属、志贺菌属、爱德华菌属和耶尔森菌属均为阴性，沙门菌属、克雷伯菌属通常为阳性。
2.丙二酸盐利用试验：克雷伯菌属为阳性，枸橼酸杆菌属、肠杆菌属和哈夫尼亚菌属中有些菌种也呈阳性，其他菌属均为阴性。
各种酶类试验
1.氧化酶试验：用于肠杆菌科细菌与假单胞菌的鉴别，前者为阴性，后者为阳性。奈瑟菌属、莫拉菌属细菌也呈阳性反应。
2.过氧化氢酶试验（触酶试验）：革兰阳性球菌中，葡萄球菌和微球菌均产生过氧化氢酶，而链球菌属为阴性，故此试验常用于革兰阳性球菌的初步分群。
3.硝酸盐还原试验：肠杆菌科细菌均能还原硝酸盐为亚硝酸盐；铜绿假单胞菌、嗜麦芽窄食单胞菌等假单胞菌可产生氮气；有些厌氧菌如韦荣球菌等试验也为阳性。
4.脂酶试验：用于厌氧菌的鉴别。类杆菌属中的中间类杆菌产生脂酶，其他类杆菌则为阴性；芽胞梭菌属中产芽胞梭菌、肉毒梭菌和诺维梭菌也有此酶，而其他梭菌为阴性。
5.卵磷脂酶试验：主要用于厌氧菌的鉴定。产气荚膜梭菌、诺维梭菌产生此酶，其他梭菌为阴性。
6.DNA酶试验：在革兰阳性球菌中只有金黄色葡萄球菌产生DNA酶，在肠杆菌科中沙雷菌和变形杆菌产生此酶，故本试验可用于细菌的鉴别。
7.凝固酶试验：作为鉴定葡萄球菌致病性的重要指标。
8.CAMP试验：在链球菌中，只有B群链球菌CAMP试验阳性，故可作为特异性鉴定。
9.胆汁溶菌试验：用于肺炎链球菌与甲型链球菌的鉴别，前者为阳性，后者为阴性。
抑菌试验
1.0/129抑菌试验：用于弧菌科的属间鉴别，弧菌属、邻单胞菌属对0/129敏感，而气单胞菌属耐药。
2.杆菌肽试验：用于A群链球菌与非A群链球菌的鉴别。
3.奥普托欣（Optochin）试验：用于肺炎链球菌与其他链球菌的鉴别。
血液感染常见病原菌
革兰阳性
革兰阴性
球菌
金黄色葡萄球菌、凝固酶阴性葡萄球菌、A、B群链球菌、肺炎链球菌、肠球菌、草绿色链球菌
脑膜炎奈瑟菌、卡他布兰汉菌
杆菌
产单核细胞李斯特菌、炭疽杆菌、结核分枝杆菌、产气荚膜梭菌
大肠埃希菌、伤寒、副伤寒沙门菌、克雷伯菌、沙雷菌、铜绿假单胞菌、不动杆菌、气单胞菌、流感嗜血杆菌、布鲁菌属、嗜肺军团菌、类杆菌
真菌
假丝酵母菌、曲酶菌、隐球菌、球孢子菌
中枢神经系统感染常见病原菌
革兰阳性菌
革兰阴性菌
病毒
真菌及其他
葡萄球菌
脑膜炎奈瑟菌
乙型脑炎病毒
新生隐球菌
肺炎链球菌
卡他莫拉菌
柯萨奇病毒
假丝酵母菌
草绿色链球菌
流感嗜血杆菌
脊髓灰质炎病毒
钩端螺旋体
A群链球菌
肠杆菌科细菌
新肠道病毒68-71型
B群链球菌
非发酵菌
狂犬病毒
结核分枝杆菌
炎杆菌
产单核李斯特菌
消化链球菌
呼吸道感染常见病原菌
革兰阳性
革兰阴性
球菌
葡萄球菌；肺炎链球菌；化脓性链球菌；肠球菌
卡他莫拉菌；脑膜炎奈瑟菌
杆菌
白喉棒状杆菌；结核分枝杆菌；炭疽芽胞杆菌
流感嗜血杆菌；大肠埃希菌；克雷伯菌；铜绿假单胞菌；肺炎支原体；军团菌；百日咳杆菌
真菌
白假丝酵母菌；隐球菌；曲霉菌；毛霉菌
病毒
流感病毒；副流感病毒；呼吸道合胞病毒；腺病毒；麻疹病毒；巨细胞病毒
尿路感染常见病原菌
革兰阳性
革兰阴性
球菌
葡萄球菌属；肠球菌；化脓性链球菌
淋病奈瑟菌
杆菌
结核分枝杆菌
大肠埃希菌；肠杆菌；非发酵菌；变形杆菌；沙门菌；沙雷菌；阴道加德纳菌；布鲁菌属；克雷伯菌
其他
真菌、厌氧菌
消化道感染常见病原菌
肠毒素为主的病原菌
侵袭性为主的病原菌
病毒
金黄色葡萄球菌；霍乱弧菌；志贺菌属；大肠埃希菌（ETEC、EHEC、EAggEC）；产气荚膜梭菌；艰难梭菌
沙门菌属；志贺菌属；，大肠埃希菌（EPEC、EIEC）；小肠结肠炎耶尔森菌；副溶血弧菌；结核分枝杆菌；白假丝酵母菌
轮状病毒，埃可病毒；Norwalk病毒；腺病毒
创伤和外科感染常见病原菌
革兰阳性
革兰阴性
球菌
金黄色葡萄球菌、凝固酶阴性葡萄球菌、肺炎链球菌、肠球菌、消化链球菌
脑膜炎奈瑟菌、卡他布兰汉菌
杆菌
炭疽杆菌、结核分枝杆菌、产气荚膜杆菌、非结核分枝杆菌、破伤风梭菌
大肠埃希菌、克雷伯菌、变形杆菌、铜绿假单胞菌、流感嗜血杆菌、类杆菌、梭杆菌
其他
放线菌（衣氏放线菌、诺卡菌）