一般来说，优良的菌种一般会具备以下六点特征：
生长整齐
同一品种，使用相同的培养基，在相同培养条件下，长速和长相应基本相同。
菌丝丰满
优良的原种，菌丝丰满、浓密、均匀。如菌丝干瘪、萎缩则不可使用。
菇香味浓郁
正常的原种，打开瓶(袋)口，可闻到浓郁的菇香味。如果气味清淡或无香味，甚至有一股异味，说明菌种有问题，不能使用。
无其他生物污染
污染的真菌易于鉴别，有各类各色的孢子。细菌常被忽略，肉眼鉴别较难。
长速正常
不同品种、不同培养基、不同生长条件长速不同，但是每一个品种，在固定的培养基和培养条件下，有其固定的生长速度。
长相正常
不同种类的菌种长相不同，但同一品种不同个体长相要一致，包括色泽和色素产生的早晚、菌落厚度、气生菌丝多寡、背面色泽等。